MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 6

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014303	CCA	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883500
2	NC_014303	GTCG	2	8	2250	2257	0 %	25 %	50 %	25 %	299883500
3	NC_014303	CGTC	2	8	2259	2266	0 %	25 %	25 %	50 %	299883500
4	NC_014303	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883500
5	NC_014303	GCGG	2	8	2376	2383	0 %	0 %	75 %	25 %	299883500
6	NC_014303	TCG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883500
7	NC_014303	GGT	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883500
8	NC_014303	GA	3	6	2486	2491	50 %	0 %	50 %	0 %	299883500
9	NC_014303	CGGCCA	2	12	2495	2506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	299883500
10	NC_014303	GCCC	2	8	2525	2532	0 %	0 %	25 %	75 %	299883500
11	NC_014303	CGAC	2	8	2559	2566	25 %	0 %	25 %	50 %	299883500
12	NC_014303	CGG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883500
13	NC_014303	CT	3	6	2726	2731	0 %	50 %	0 %	50 %	299883500
14	NC_014303	GAC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883500
15	NC_014303	GGTC	2	8	2814	2821	0 %	25 %	50 %	25 %	299883500
16	NC_014303	TCGGG	2	10	2826	2835	0 %	20 %	60 %	20 %	299883500
17	NC_014303	GGC	2	6	2847	2852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883500
18	NC_014303	ACGG	2	8	2884	2891	25 %	0 %	50 %	25 %	299883500
19	NC_014303	CCG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883501
20	NC_014303	ACT	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883501
21	NC_014303	TCG	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
22	NC_014303	GACG	2	8	3023	3030	25 %	0 %	50 %	25 %	299883501
23	NC_014303	GCT	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
24	NC_014303	GA	3	6	3138	3143	50 %	0 %	50 %	0 %	299883501
25	NC_014303	GGC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883501
26	NC_014303	CGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883501
27	NC_014303	CTCA	2	8	3245	3252	25 %	25 %	0 %	50 %	299883501
28	NC_014303	G	6	6	3295	3300	0 %	0 %	100 %	0 %	299883501
29	NC_014303	CTG	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
30	NC_014303	GTG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883501
31	NC_014303	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883501
32	NC_014303	ACA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883502
33	NC_014303	CGGC	2	8	3848	3855	0 %	0 %	50 %	50 %	299883502
34	NC_014303	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883503
35	NC_014303	GGA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
36	NC_014303	CGG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883503
37	NC_014303	GAG	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
38	NC_014303	GCGG	2	8	3955	3962	0 %	0 %	75 %	25 %	299883503
39	NC_014303	GTG	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883503
40	NC_014303	GTC	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883503
41	NC_014303	GGC	2	6	4016	4021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883503
42	NC_014303	GAG	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
43	NC_014303	GTG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883503
44	NC_014303	GAG	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
45	NC_014303	TA	4	8	5187	5194	50 %	50 %	0 %	0 %	299883504
46	NC_014303	AG	3	6	5197	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	299883504
47	NC_014303	CATC	2	8	5208	5215	25 %	25 %	0 %	50 %	299883504
48	NC_014303	CGAG	2	8	5225	5232	25 %	0 %	50 %	25 %	299883504
49	NC_014303	GAA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883504
50	NC_014303	ACTC	2	8	5624	5631	25 %	25 %	0 %	50 %	299883505
51	NC_014303	ACG	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
52	NC_014303	AGG	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883505
53	NC_014303	CAG	3	9	5740	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
54	NC_014303	AGG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883505
55	NC_014303	TTG	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883505
56	NC_014303	CAG	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
57	NC_014303	GTG	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883505
58	NC_014303	TGC	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883506
59	NC_014303	C	6	6	6002	6007	0 %	0 %	0 %	100 %	299883506
60	NC_014303	GAC	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883506
61	NC_014303	GTT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883506

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.